Το γνωστό, αναγνωρίσιμο και διαχρονικό σχήμα του Mini Cooper S διατηρείται και στο John Cooper Works, μιας και σε αυτό βασίζεται. Μεγάλα φώτα, ενιαία μπροστινή μάσκα, "διακοσμητικό" scoop στο καπό, χαμηλό αμάξωμα είναι ελάχιστα από τα σχεδιαστικά highlights του Cooper R56. Στην έκδοση Works η σιλουέτα έχει δεχθεί αισθητικές τονώσεις, που αποτελούνται από νέο μπροστινό προφυλακτήρα με μεγαλύτερη εισαγωγή για το intercooler, πανάλαφρες ζάντες 17in, τα αεροδυναμικά βοηθήματα, η διπλή απόληξη της εξάτμισης και ο διαχύτης στο πίσω μέρος με επένδυση αυθεντικού carbon.